Le profil du haflinger trahit indéniablement ses origines Arabe. Sa tête est plûtot légère et concave. Certains sujets portent une tête plus arabisée que d'autres. cela est dû essentiellement aux différentes origines car certaines lignées d'étalons ont concervé plus que d'autres les héritages de Pur sang.
Dans ses généralités, la tête doit être courte et sèche. Elle doit être expressive et accompagnée d'un oeil vif, souvent synonyme de vitalité.
Comme la plupart des chevaux rustiques issus notamment des milieux montagnards, le haflinger porte des petites oreilles. Ceci leur permettait de se proteger les désagréments des vents et du froid de l'altitude.